Представлены инструменты, позволяющие исследователям делиться научными рабочими процессами, протоколами, планами экспериментов и другими цифровыми объектами.
Первый документ, который исследователи создают при разработке нового проекта, – это научный протокол. Иногда его называют описанием проекта, потому что это, по сути, описание исследовательского вопроса и подробный план того, как ученый собирается на него ответить. Protocol.IO позволяет пользователям в электронном виде создавать протокол исследования, проверять шаги протоколов и добавлять комментарии к протоколам. С помощью этого инструмента можно легко структурировать исследование. Предоставление протокол вместе с публикацией повышает воспроизводимость и надежность исследования.
Протоколы могут быть опубликованы для всеобщего обозрения или переданы конфиденциально. Все протоколы (частные или общедоступные) можно аннотировать и обсуждать на уровне шага или протокола. Можно связать протокол с опубликованной статьей. Все протоколы по умолчанию являются частными, но после публикации не требуется регистрация или какие-либо другие препятствия для доступа к общедоступному контенту. Весь опубликованный контент, предоставленный автором, имеет лицензию CC-BY.
Protocol.IO позволяет добавлять авторов/соавторов; руководства, ссылки и другую полезную информацию, сопровождающую протокол; любые необходимые приготовления или информацию, о которой читатель должен знать перед началом эксперимента, меры предосторожности, если протокол включает работу с опасными материалами; предупреждение о конфиденциальном контенте.
После публикации протокола можно запустить протокол и начать следовать ему пошагово.
Протоколы на данной платформе динамичны и интерактивны. В отличие от статических PDF-файлов, их можно «запускать» в Интернете и на мобильных устройствах, что позволяет пользователям пошагово следовать методу во время эксперимента, выполнять технику, легко записывать любые изменения в процессе и сохранять выходные файлы и детали. пробега. Что еще более важно, любой метод можно обсудить и улучшить на сайте Protocols.io спустя долгое время после публикации.
Protocols.io позволяет собирать все детали вычислительного анализа (параметры, особенности конвейеров, версии и расположение наборов данных, программное обеспечение и т. д.). Другие пользователи, желающие использовать ваш метод, получат пошаговую инструкцию для его выполнения. Совместное использование вычислительных рабочих процессов на протоколах.io не предназначено для замены GitHub или Jupyter Notebooks, а предназначено для работы в тандеме со ссылками на эти платформы.