Для проведения анализа в системе собрано 20 инструментов. Например:
Jupyter Notebook – это программа-блокнот для записи, передачи и запуска кода. Ей можно пользоваться как своеобразной средой разработки. Она существует как веб-сервис, то есть доступна через интернет и позволяет передавать код другим разработчикам. Jupyter уже несколько лет считается одним из популярных инструментов для анализа данных и быстрого прототипирования.
DataWarrior– это интерактивная, многоцелевая программа визуализации и анализа данных с учетом химических процессов. DataWarriorпредоставляет интерактивные представления для визуализации данных, выявления корреляций и извлечения скрытых знаний из больших наборов данных. Фильтры данных позволяют динамически фокусироваться на определенных подмножествах данных. В программу встроен химический интеллект, позволяющий работать с химическими структурами так же легко, как и с числовыми значениями. Данные можно фильтровать по структурным мотивам, взгляды учитывают химию, свойства молекул можно предсказать на основе химических структур, а специализированные методы хемоинформатики исследуют взаимосвязь между химической структурой и измеряемыми свойствами.
Galaxy – это платформа для научного рабочего процесса, интеграции данных, хранения и публикации данных и анализа, цель которой – сделать вычислительную биологию доступной для ученых-исследователей, не имеющих опыта компьютерного программирования или системного администрирования.