OpenRefine — это мощный бесплатный инструмент с открытым исходным кодом для работы с сырыми данными, их очистки и преобразования из одного формата в другой.
Jupyter Notebook — это программа-блокнот для записи, передачи и запуска кода. Ей можно пользоваться как своеобразной средой разработки. Она существует как веб-сервис, то есть доступна через интернет и позволяет передавать код другим разработчикам.
Indigo ELN - электронный лабораторный блокнот с открытым исходным кодом, проверенный способ создания, хранения, извлечения и обмена электронными записями химической информации способами, отвечающими всем юридическим, нормативным, техническим и научным требованиям.
rOpenSci - программные инструменты R для работы с локальными и удаленными источниками научных данных: преобразование данных, визуализация и публикация данных, взаимодействие с веб-ресурсами, обработка изображений, защита данных, статистические алгоритмы и другое.
Labfolder — это электронный лабораторный блокнот, платформа для повышения производительности и совместной работы упрощает создание, поиск, совместное использование, обсуждение и проверку данных исследований в команде. labfolder полностью бесплатен для индивидуального использования и для групп до 3 пользователей.
Avogadro — это продвинутый редактор и визуализатор молекул, предназначенный для кросс-платформенного использования в вычислительной химии, молекулярном моделировании, биоинформатике, материаловедении и смежных областях.
DataWarrior - бесплатная химико-информатическая программа для визуализации и анализа данных. Сочетает в себе динамические графические представления и интерактивную фильтрацию строк с химическим интеллектом. Диаграммы разброса, диаграммы с блоками, гистограммы и круговые диаграммы не только визуализируют числовые данные или данные категорий, но также показывают тенденции нескольких каркасов или составных шаблонов замещения. Химические дескрипторы кодируют различные аспекты химической структуры, например, химический граф, химическую функциональность с точки зрения химика-синтетика или трехмерные характеристики фармакофора.
LimeSurvey - бесплатное веб-приложение с открытым исходным кодом, которое позволяет пользователям разрабатывать и публиковать опросы, а также собирать ответы.
SmartSurvey - инструмент для создания опросов, составления анкет и анализа результатов.
Google Forms - бесплатный онлайн-инструмент от Google, который позволяет пользователям создавать формы, опросы и викторины, а также совместно редактировать формы и делиться ими с другими людьми.
RStudio - предоставляет профессиональное программное обеспечение с открытым исходным кодом и готовое к работе для обработки данных.
OpenML — это онлайн-платформа и сервис для машинного обучения, цель которого — сделать машинное обучение и анализ данных простыми, доступными, совместными и открытыми. Он доступен для всех бесплатно. Его можно использовать для загрузки или загрузки данных OpenML, таких как наборы данных и результаты экспериментов по машинному обучению. Он обеспечивает легкий доступ ко всем наборам данных, задачам и экспериментам на OpenML из Python.
Qualtrics — это облачный инструмент для проведения опросов, который помогает преподавателям, студентам и сотрудникам создавать и распространять опросы, просматривать отчеты, а также составлять таблицы и анализировать ответы. Qualtrics позволяет создавать сложные опросы, отвечающие различным исследовательским потребностям.
Tatool - пакет программного обеспечения с открытым исходным кодом для создания и проведения компьютерных экспериментов. Dключает в себя функции, важные для обучения (например, настраиваемые графики обучения, адаптивные алгоритмы обучения и индивидуальную статистику обучения) и позволяет проводить исследования в режиме онлайн через Java Web Start. Tatool публикуется с открытым исходным кодом под лицензией GNU Lesser General Public License.
Microsoft Power BI Desktop создан для аналитиков. Он сочетает в себе современные интерактивные визуализации с ведущими в отрасли встроенными функциями запроса данных и моделирования.
KNIME Analytics Platform — это программное обеспечение с открытым исходным кодом и интуитивно понятным визуальным интерфейсом, которое позволяет проводить анализ любого уровня сложности. Получайте доступ, смешивайте, анализируйте и визуализируйте данные без какого-либо программирования или интегрируйте свои любимые инструменты и библиотеки по мере необходимости.
WINGS (Workflow INstance Generation and Selection) — это семантическая система рабочего процесса, которая помогает ученым в планировании вычислительных экспериментов. Уникальной особенностью WINGS является то, что его представления рабочих процессов включают семантические ограничения в отношении наборов данных и компонентов рабочего процесса и используются для создания и проверки рабочих процессов и генерации метаданных для новых продуктов данных.
Galaxy — это платформа для научного рабочего процесса, интеграции данных, хранения и публикации данных и анализа, цель которой — сделать вычислительную биологию доступной для ученых-исследователей, не имеющих опыта компьютерного программирования или системного администрирования.
Kumu позволяет легко организовать сложные данные в карты отношений.
NanoHUB.org предоставляет услуги «онлайн-симуляции и многое другое». Более 85 интерактивных инструментов моделирования, поддерживаемых учебными пособиями и общими информационными материалами по нанотехнологиям, доступны всем бесплатно. На nanoHUB развернуто более 100 инструментов моделирования.