Существует большое количество инструментов для помощи в визуализации результатов исследований – изображений, молекул, данных. Инструменты визуализации данных обеспечивают интерактивность и воспроизводимость онлайн-публикаций. Есть руководства, рассматривающие базовые методы работы с инструментов.
В помощь исследователям библиотекари могут предложить использовать например:
GIMP — Бесплатный редактор изображений с открытым исходным кодом. Полезно для редактирования изображений, рисования произвольной формы, преобразования между различными форматами изображений и других специализированных задач.
ImageJ — Программа обработки изображений на основе Java с широким набором подключаемых модулей, включая трехмерную визуализацию живых клеток, обработку радиологических изображений, сравнение данных нескольких систем визуализации и автоматизированные гематологические системы.
В отличие от большинства программ обработки изображений, ImageJ не имеет основной рабочей области. Главное окно ImageJ содержит только строку меню, содержащую все команды меню, панель инструментов, строку состояния и индикатор выполнения. Изображения, гистограммы, профили, виджеты и т.п. отображаются в дополнительных окнах. Результаты измерений отображаются в Таблице результатов. Большинство окон можно перетаскивать по экрану и изменять их размер. Есть обширное руководство по использованию инструмента
Avogadro – это редактор и визуализатор молекул, предназначенный для кросс-платформенного использования в вычислительной химии, молекулярном моделировании, биоинформатике, материаловедении и смежных областях. На сайте представлено подробное руководство по использованию Avogadro, а также инструкция для новичков.
Plotly позволяет пользователям создавать и совместно использовать визуализации, начиная от точечных диаграмм и линейных графиков и заканчивая контурными графиками и картами. Полученные изображения позволяют пользователям увеличивать данные, перемещаться по изображениям и наводить указатель мыши на точки, чтобы увидеть нанесенные значения. Пример статьи с интерактивными изображениями.
RAW Graphs – это платформа визуализации данных с открытым исходным кодом, позволяет сделать визуальное представление сложных данных простым для всех. Обеспечивает связь между приложениями для работы с электронными таблицами (например, Microsoft Excel, Apple Numbers, OpenRefine) и редакторами векторной графики (например, Adobe Illustrator, Inkscape, Sketch). Для пользователей предлагаются обучающие материалы по использованию инструмента.